マナー違反ではないと思います。 テレビの大食い番組でも食べ残した分は持ち帰って（るように演出されて）いますし、厚生労働省も食べ残しの持ち帰りガイドラインを作ってます。 最近のフードロス削減の風潮とも合致するのではないでしょうか。