Lumbung biomassa adalah gudang mikroba. Mikroba memiliki peran penting dalam pertanian berkelanjutan, terutama dalam pengolahan bahan organik menjadi pupuk. Sebagian besar proses pengomposan mensyaratkan pemberian inokulan/starter secara berkala. Ketergantungan terhadap sumber inokulan sering menjadi penyebab mengapa komposter yang ada mangkrak tidak digunakan lagi. Lumbung biomassa yang berisi tabungan daun kering, sesungguhnya sangat kaya dengan aneka mikroba yang ada di sekitar kita.