測謊器主要是透過心跳速率、血壓變化、呼吸頻率、汗腺活動等等生理結構做數據 但生理變化會受到多種因素影響。 有些受測者本身就容易焦慮、害怕、不安；有些訓練有素的職業犯罪，可以有效控制呼吸和生理反應， 這些都會導致誤判，所以本來就存在爭議。