有些實驗像是ChIP seq or RNA seq 根本不會有人要求要做三重複！一樣是做ChIP但後面anti-sequence probe 去呈現顏色，不做三次就會被各種說 data 不夠完整？（最後我還是認命乖乖弄三次

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2025-03-11 02:09

有些實驗像是ChIP seq or RNA seq 根本不會有人要求要做三重複！一樣是做ChIP但後面anti-sequence probe 去呈現顏色，不做三次就會被各種說 data 不夠完整？（最後我還是認命乖乖弄三次

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2 小時內	億祥劉 twobrassieres	因為每上一次sequence至少要花上一萬以上金額，實驗室沒錢進行三重複
3 小時內	Sseu-Pei Hwang fourmi0902	大部分Seq的要求是兩次以上的biological rep喔 https://www.encodeproject.org/documents/cede0cbe-d324-4ce7-ace4-f0c3eddf5972/@@download/attachment/ENCODE%20Best%20Practices%20for%20RNA_v2.pdf 是說不做重複的話，要怎麼分析seq data@@ 連volcano plot都做不出來的說
3 小時內	賴玠羽 jieyu.lai	認真講從reviewer 的角度來說定序如果ChIP enrichment 沒做好背景值很髒peak根本call 不出來所以通常一次人家就會相信，RNA seq現在一重複也不行要兩重複才有正常的p值，low through put 的實驗人家不知道你的實驗有沒有控制好乾脆叫你三重複
4 小時內	Cliff Lang cliff_1027	Seq就是最少要兩個，不然你怎麼比較DEGs? 如果是pilot exp.還可以!
6 小時內	gengar5566	三個資料點才能勉強叫一個distribution
3 天內	Timothy Chan 恩浩 timothykoala	RNAseq 要三重複蠻常見的。 ChIP的話peak calling 如果給比較高的filtering 目前暫時就沒有很強硬的要求